1、稽查查补收入如何申报？

《增值税一般纳税人登记管理办法》第二条规定，本办法所称年应税销售额，是指纳税人在连续不超过12个月或四个季度的经营期内累计应征增值税销售额，包括纳税申报销售额、稽查查补销售额、纳税评估调整销售额。因此，企业除了申报开票收入外，还应申报稽查查补收入、纳税评估收入。在增值税申报表附表一中有“纳税检查调整”栏，企业被检查后如需自行更正申报增值税，可以在此栏中填列稽查查补收入。

2、以前年度取得的发票，暂未扣除的可以追补确认吗？

对企业发现以前年度实际发生的、按照税收规定应在企业所得税前扣除而未扣除或者少扣除的支出，企业做出专项申报及说明后，准予追补至该项目发生年度计算扣除，但追补确认期限不得超过5年。企业由于上述原因多缴的企业所得税税款，可以在追补确认年度企业所得税应纳税款中抵扣，不足抵扣的，可以向以后年度递延抵扣或申请退税。亏损企业追补确认以前年度未在企业所得税前扣除的支出，或盈利企业经过追补确认后出现亏损的，应首先调整该项支出所属年度的亏损额，然后再按照弥补亏损的原则计算以后年度多缴的企业所得税款，并按前款规定处理。

3、对境外机构投资境内债券市场取得的债券利息收入有什么税收优惠？

根据《财政部 税务总局关于延续境外机构投资境内债券市场企业所得税、增值税政策的公告》（财政部 税务总局公告2021年34号）规定：“自2021年11月7日起至2025年12月31日止，对境外机构投资境内债券市场取得的债券利息收入暂免征收企业所得税和增值税。上述暂免征收企业所得税的范围不包括境外机构在境内设立的机构、场所取得的与该机构、场所有实际联系的债券利息。

4、对实行增值税期末留抵退税的纳税人，其城市维护建设税计税依据中可以扣除退还的增值税税额吗？

根据《城市维护建设税法》（第五十一号）第二条第二款规定，城市维护建设税的计税依据应当按照规定扣除期末留抵退税退还的增值税税额。根据《关于城市维护建设税计税依据确定办法等事项的公告》（公告2021年第28号）第一条规定，城市维护建设税以纳税人依法实际缴纳的增值税、消费税税额(以下简称两税税额)为计税依据。依法实际缴纳的两税税额，是指纳税人依照增值税、消费税相关法律法规和税收政策规定计算的应当缴纳的两税税额(不含因进口货物或境外单位和个人向境内销售劳务、服务、无形资产缴纳的两税税额)，加上增值税免抵税额，扣除直接减免的两税税额和期末留抵退税退还的增值税税额后的金额。